回眸2020 | ABclonal助力高影响力研究及文献盘点(服务篇)

 

聚焦

不平静的2020年已然过去,从科研抗体定制到高端诊断原料和抗体药物发现,ABclonal技术服务项目系统下单的总数突破10,000+,为了感谢广大新老用户与合作伙伴的关心与支持,小编将这一年来收录的ABclonal服务引用文献进行了盘点,将不同领域代表性成果或者新方法进行了概括,以供科研工作者参考。

1.同济大学医学院戈宝学团队揭示结核菌逃逸抗结核免疫新机制

题目:Host-mediated ubiquitination of a mycobacterial protein suppresses immunity
期刊:Nature
影响因子:43.07
作者及单位:同济大学附属上海市肺科医院王琳博士、同济大学医学院硕士吴厥慧、上海科技大学免疫化学研究所副研究员李俊为该论文的共同第一作者,饶子和院士和戈宝学教授为论文的共同通讯作者
ABclonal服务项目:Rv0222蛋白表达及抗体定制

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推荐理由:这项研究工作完整阐述了结核菌利用人体泛素化系统抵御人体免疫攻击的逃逸机制,这一对人体蛋白质修饰系统帮助结核菌感染致病新机制的发现,拓宽了我们对蛋白质修饰系统在感染性疾病调控中作用的视野。同时,研究者通过蛋白结构分析和功能探索,精准指出Rv0222毒力蛋白是在其76位点的赖氨酸上发生K-11泛素化修饰后发挥毒力,可以在后续研究中为新型抗结核药物的开发提供更精准的靶点。

 

2.南方科技大学郭红卫团队报道植物siRNA领域突破性进展

题目:Plant 22-nt siRNAs mediate translational repression and stress adaptation
期刊:Nature
影响因子:43.07
作者及单位:访问学生吴辉辉博士(北京大学)和研究助理教授李博生为第一作者,南方科技大学郭红卫教授为通讯作者
ABclonal服务项目:NIA1抗体定制

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推荐理由:小干扰RNA(siRNA)对于真核生物的正常发育和免疫力至关重要。植物产生的siRNA的长度为21、22或24个核苷酸。21和24个核苷酸分别介导信使RNA的切割和DNA甲基化,但22个核苷酸的siRNA的生物学功能仍然未知。该研究鉴定和表征一组由植物中的DICER-LIKE 2(DCL2)蛋白产生的内源性22个核苷酸的siRNA。产生22个核苷酸的siRNA会触发基因沉默的扩增,并导致基因特异性和整体性的翻译抑制。此外,这些22个核苷酸的siRNA优先在环境胁迫下积累,尤其是那些源自NIA1 / 2的siRNA,它们起着抑制翻译,抑制植物生长和增强胁迫反应的作用。因此,该研究揭示了22个核苷酸的siRNA的独特特性,并揭示了它们在植物适应环境胁迫中的重要性。

 

3.上海植物逆境生物学研究中心Rosa Lozano Duran团队揭示连接细胞膜和叶绿体的信号传递途径

题目:A Defense Pathway Linking Plasma Membrane and Chloroplasts and Co-opted by Pathogens
期刊:Cell
影响因子:38.637
作者及单位:上海植物逆境生物学研究中心Rosa Lozano Duran研究员为该论文通讯作者
ABclonal服务项目:Flg22和Elf18多肽合成

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推荐理由:该研究揭示了一条连接细胞膜和叶绿体的重要信号传递途径,病原体可以劫持这种在植物细胞内部传递信息的途径,抑制植物防御反应的激活。另外,该研究还发现不同类别的病原体进化出相似的策略来利用这种植物途径,达到抑制植物防御的目的,有力证明了这条连接细胞膜和叶绿体的信号传递途径在植物与微生物相互作用中起着核心作用。真菌、细菌、病毒等多种植物病原体在全球范围内对农作物生产造成了巨大损失,严重威胁世界粮食安全。这种新途径的发现为设计的植物保护策略和开发新的抗病品种提供了新思路。重要的是,该研究表明在没有病原体存在的情况下可以增加植物对病原体的防御能力而不影响其生产力,从而达到改善植物抗性和不影响植物生长的双重目的。

 

4.上海植物逆境生物学研究中心Alberto Macho团队揭示青枯病菌效应蛋白挟持植物代谢以支持细菌营养

题目:A Bacterial Effector Protein Hijacks Plant Metabolism to Support Pathogen Nutrition
期刊:Cell Host Microbe
影响因子:15.923
作者及单位:中国科学院分子植物科学卓越创新中心上海植物逆境生物学研究中心Alberto Macho为论文通讯作者
ABclonal服务项目:RipI和GAD抗体定制

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推荐理由:该研究揭示了青枯病菌的效应蛋白挟持植物代谢以合成GABA,促进细菌生长和定殖的机制。由植物病原细菌引起的病害对全世界粮食安全造成重大威胁,这一机制揭示了细菌利用植物代谢途径的敏感调节来为细菌病原体提供营养的新策略。有趣的是,谷氨酸脱羧酶活性降低了的突变植物对细菌性青枯病更具抵抗力,表明谷氨酸脱羧酶是植物体内的易感性因素。这一发现也进一步证实了有针对性地编辑谷氨酸脱羧酶以增强植物抗病性的可能性。

 

5.中南大学基础医学院病理学系肖德胜团队与肿瘤研究所陶永光团队发现影响肺癌恶性表型新机制

题目:The cross-talk between methylation and phosphorylation in lymphoid-specific helicase drives cancer stem-like properties
期刊:Signal Transduction and Targeted Therapy
影响因子:13.493
作者及单位:肖德胜教授和陶永光研究员为本论文的共同通讯作者,中南大学博士研究生刘娜为第一作者
ABclonal服务项目:LSH-R309me1和LSH-pS503多肽合成和抗体定制

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推荐理由:研究者以肺癌为研究模型,率先报道了精氨酸甲基转移酶PRMT5可通过与LSH相互作用促使LSH的309位点发生精氨酸甲基化(R309me1),丝裂原活化蛋白激酶MAPK1可促使LSH的503位点发生丝氨酸磷酸化(p503);R309me1与p503间存在着相拮抗的关系,LSH的R309me1可通过下调干细胞相关基因(ABCG2、ALDH1A1及SOX2等)启动子区H3K4me3/H3K27me3的比值抑制干细胞相关分子的表达,抑制CSCs样特性的维持,而LSH 的p503可通过上调该比值促进干细胞相关分子的表达,进而维持CSCs表型。该合作团队首次揭示了LSH存在蛋白质翻译后修饰(PTMs),其PTMs间存在着信号交流,且共同参与调控CSCs样特性的维持,进而影响肺癌的恶性表型。该项目从PTMs及CSCs角度,强调了LSH作为抗癌药物新靶点的潜在意义。

 

6.福建农林大学海峡联合研究院徐通达团队揭示生长素合成调控的新机制

题目:A phosphorylation-based switch controls TAA1-mediated auxin biosynthesis in plants
期刊:Nature Communications
影响因子:12.121
作者及单位:上海植物逆境生物学研究中心为该工作的第一完成单位,福建农林大学海峡联合研究院园艺中心为共同完成单位,上海植物逆境生物学研究中心博士研究生王倩,博士后秦国臣为该文共同第一作者,福建农林大学海峡联合研究院园艺中心徐通达教授为论文通讯作者
ABclonal服务项目:TMK4蛋白表达和抗体定制

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推荐理由:作者发现拟南芥中一个生长素合成关键酶TAA1的101号氨基酸苏氨酸(T101)被磷酸化,而该位点上的磷酸化状态可以激活或关闭TAA1依赖型的生长素合成,且对于根分生组织大小以及根毛发育的恰当调控是必需的。TAA1上T101位点的磷酸化在演化上十分保守,说明生长素合成的翻译后调控可能是一个比较常见的现象。另外,作者还发现生长素本身会通过TMK4诱导TAA1上T101位点的磷酸化,说明存在一个自调控的环,从而局部的生长素信号可以抑制生长素的合成。作者得出的结论是植物响应于内部或外部的信号,通过磷酸化依赖性的TAA1酶活调控作用于生长素浓度的调控。该研究首次报道了生长素合成在转录后水平的调控机制,为探究植物生长素浓度调控提供了新的思路和方向,帮助人们更好地理解植物如何通过调节体内生长素水平的变化去应对复杂的发育信号和环境信号。

 

7.西北农林科技大学Israel Ausin团队在拟南芥染色质重塑领域取得突破

题目:NAP1-RELATED PROTEIN 1 and 2 negatively regulate H2A.Z abundance in chromatin in Arabidopsis
期刊:Nature Communications
影响因子:12.121
作者及单位:西北农林科技大学染色质生物学研究团队的王亚飞副教授和UCLA的钟振晖博士为该论文共同第一作者,UCLA的Steven E.Jacobsen院士和西北农林科技大学染色质生物学研究团队的Israel Ausin教授为共同通讯作者
ABclonal服务项目:H2A和H2A.Z抗体定制

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推荐理由:NRP1和NRP2是重要的组蛋白伴侣,能够负调控拟南芥染色质中H2A.Z含量,并和另一个重要的组蛋白伴侣SWR1相互拮抗,二者共同调控植株染色质中H2A.Z的动态平衡,在保证基因组稳定性的同时,赋予了植物发育和环境适应方面的可塑性。该研究揭示了组蛋白伴侣NRPs介导H2A.Z从染色质中去除的分子机制。

 

8.中国科学技术大学史庆华团队揭示DNAH17错义突变导致精子尾部结构不稳定及弱精子症

题目:A DNAH17 missense variant causes flagella destabilization and asthenozoospermia
期刊:The Journal of Experimental Medicine
影响因子:11.743
作者及单位:中国科学技术大学史庆华教授为该论文通讯作者
ABclonal服务项目:DNAH17蛋白表达和抗体定制

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推荐理由:该研究首次报道了DNAH17(dynein axonemal heavy chains)纯合错义突变特异引发4-7号微管二联体不稳定,并导致弱精子症。该研究成果首次揭示动力臂蛋白对维持精子尾部轴丝结构的稳定是必需的,也提示精子尾部9组微管二联体的结构、分子组成和性质可能不同。这些发现不仅加深了对精子尾部轴丝结构的认识,也为这类弱精子症患者的诊断、研发新的治疗方法、以及以生育为目的的指导同房等提供了科学依据

 

9.中科院水生所肖武汉团队解析去琥珀酰化酶SIRT5在抗病毒先天免疫中的功能和机制

题目:SIRT5 impairs aggregation and activation of the signaling adaptor MAVS through catalyzing lysine desuccinylation
期刊:The EMBO Journal
影响因子:9.889
作者及单位:中科院水生所刘兴副研究员和朱纯纯博士为该论文共同第一作者,肖武汉教授为通讯作者
ABclonal服务项目:succi-K7-MAVS多肽合成和抗体定制

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推荐理由:作者提出一个模型:先天免疫信号通路中的接头蛋白MAVS存在着琥珀酰化翻译后修饰,SIRT5可以与MAVS相互结合并介导MAVS的去琥珀酰化修饰,从而抑制MAVS多聚化的形成以及下游转录因子IRF3的磷酸化和二聚化,进而抑制干扰素等抗病毒相关基因的表达,从而在抗病毒先天免疫中发挥重要的生物学功能。该研究首次揭示了琥珀酰化修饰以及SIRT5介导的去琥珀酰化修饰在抗病毒先天免疫中的功能和机制。SIRT5功能和机制的揭示,也为培育抗病鱼类新品种提供了候选靶标。

 

10.南京农业大学万建民院士团队揭示稻米蛋白品质形成分子机制

题目:GPA5 Encodes a Rab5a Effector Required for Post-Golgi Trafficking of Rice Storage Proteins
期刊:The Plant Cell
影响因子:9.618
作者及单位:中国农科院作物科学研究所任玉龙副研究员、南京农业大学王益华教授、王云龙博士后和潘天博士为共同第一作者,万建民院士为通讯作者
ABclonal服务项目:GPA5 , VPS3, VPS11 , VPS18和VPS39蛋白表达和抗体定制

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推荐理由:万建民院士团队发现了一个新的谷蛋白后高尔基体分选缺陷突变体gpa5,通过图位克隆的方法证实GPA5编码一个具有磷脂结合能力的植物特有调控因子。在胚乳细胞中,GPA5特异分布在致密囊泡外围。亚细胞定位分析证实GPA5的膜定位依赖于前期鉴定的GPA1/Rab5a和GPA2/VPS9a。生化分析进一步证实GPA5可特异与GPA1/Rab5a的激活态形式互作,表明GPA5可能是GPA1/Rab5a的效应子(effector)。后续的功能研究发现,GPA5可与栓系复合体CORVET和含有VAMP727的膜融合复合体SNARE互作,介导致密囊泡与蛋白贮藏液泡的膜融合,以完成谷蛋白的转运。该研究是稻米蛋白品质形成的分子机理研究中取得的又一重要进展,进一步丰富了人们对谷蛋白转运分子网络途径的认识,为稻米蛋白品质的改良奠定了理论基础。

 

11.中国科学院分子植物科学卓越创新中心林鸿宣院士团队MAPK级联信号通过细胞分裂素代谢调控水稻穗型发育的分子机理

题目:ERECTA1 Acts Upstream of the OsMKKK10-OsMKK4-OsMPK6 Cascade to Control Spikelet Number by Regulating Cytokinin Metabolism in Rice
期刊:The Plant Cell
影响因子:9.618
作者及单位:中国科学院分子植物科学卓越创新中心博士后郭韬和博士研究生卢紫琦为共同第一作者,林鸿宣院士为通讯作者
ABclonal服务项目:OsER1和GSN1蛋白表达和抗体定制

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推荐理由:该研究首次报道了类受体激酶信号通过MAPK级联通路调控细胞分裂素代谢,进而参与水稻穗型发育的新机制,不仅为理解植物花序形态建成和可塑性的分子调控机理提供了新的视野,也为作物产量的遗传改良提供了新的策略。

 

12.中国科学院生化细胞所陈德桂团队发现H3K20去甲基化酶

题目:Histone H4K20 Demethylation by Two hHR23 Proteins
期刊:Cell Reports
影响因子:8.109
作者及单位:中国科学院生物化学与细胞生物学研究所曹雄文博士为论文第一作者和共同通讯作者,陈德桂教授为通讯作者
ABclonal服务项目:组蛋白甲基化抗体定制

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推荐理由:为了寻找新的组蛋白去甲基化酶,研究人员建立了一个高内涵筛选方法,从2,500个细胞核定位的基因中筛选出以hHR23A为代表的一类新的组蛋白H4K20的去甲基化酶,也证明了hHR23A的同源蛋白,hHR23B,也是一个H4K20的去甲基化酶。进一步研究证明hHR23A/B会通过去甲基化H4K20me1而激活基因的转录,会通过去甲基化H4K20me3而激活重复序列的转录。该研究首次发现了两个组蛋白H4K20去甲基化酶——hHR23A和hHR23B,并为找寻新的组蛋白去甲基化酶提供了一个新的筛选方法。

 

13.上海植物逆境生物学研究中心Rosa Lozano-Duran团队破译了植物病毒与宿主围绕卡哈尔体的博弈新机制

题目:A virus-encoded protein suppresses methylation of the viral genome through its interaction with AGO4 in the Cajal body
期刊:Elife
影响因子:7.08
作者及单位:中国科学院分子植物科学卓越创新中心/上海植物逆境生物学研究中心王立平博士后为该论文第一作者,Rosa Lozano-Duran研究员为通讯作者
ABclonal服务项目:V2蛋白表达和抗体定制

《回眸2020 | ABclonal助力高影响力研究及文献盘点(服务篇)》

推荐理由:该论文报道了植物病毒V2蛋白通过与宿主蛋白AGO4在卡哈尔体内相互作用抑制宿主依赖于AGO4的DNA甲基化进而提高病毒毒力。揭示了抗病防御、RNA介导的DNA甲基化(RdDM)途径和细胞核里的细胞器卡哈尔体三者之间的功能关系。该研究不但洞察了病毒与宿主博弈的新机制,而且阐明了在植物抗病防御过程中依赖于AGO4的RdDM 途径与卡哈尔体在功能上的关联。该研究成果为深入的探究宿主-病毒之间的互作,从而设计抗病策略、培育抗病作物提供了新思路。

 

14.南京农业大学万建民院士团队揭示JA和BR信号调控水稻抗条纹叶枯病新机制

题目:Rice stripe virus suppresses jasmonic acid-mediated resistance by hijacking brassinosteroid signaling pathway in rice
期刊:Plos Pathogens
影响因子:6.218
作者及单位:南京农业大学胡金龙,黄捷为该论文共同第一作者,万建民院士为通讯作者
ABclonal服务项目:OsMYC2蛋白表达和抗体定制

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