回眸2020 | ABclonal助力高影响力研究及文献盘点(产品篇)

 

聚焦

不平静的2020年已然过去,为了感谢广大新老用户与合作伙伴的关心与支持,小编将这一年来收录的ABclonal引用文献进行了盘点,将不同领域代表性成果或者新方法进行了概括,以供科研工作者参考。

1. 加州大学圣地亚哥分校付向东团队Nature封面报道治疗帕金森疾病新的再生疗法

题目:Reversing a model of Parkinson’s disease with in situ converted nigral neurons
期刊:Nature
影响因子:43.07
作者及单位:加州大学圣地亚哥分校(UCSD)付向东教授(通讯作者)
ABclonal引用产品: NG2(A3592),NANOG(A14150),nPTB(A6054),PTB(A6107),ALDH1A1(A1802)

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推荐理由:该研究发现在星形胶质细胞中敲降RNA结合蛋白PTB可将其直接转分化为功能性的神经元;这种仅需一步的转分化技术可在帕金森病小鼠模型中诱导产生新的多巴胺功能性神经元、重建受损的神经环路、恢复纹状体内多巴胺水平,并有效治疗帕金森综合征相关的运动障碍;更重要的是,使用抑制PTB的反义寡核苷酸(antisenseoligonucleotides, ASO)也能达到类似治疗效果。这项研究为帕金森病及其他神经退行性疾病提供了极具前景的治疗策略和方法,并获得了神经科学领域的广泛关注。该研究被选为Nature 的封面文章。

 

2.中科院遗传与发育生物学研究所傅向东团队Science封面揭示水稻高产且高效的分子机理

题目:Enhanced sustainable green revolution yield via nitrogen-responsive chromatin modulation in rice
期刊:Science
影响因子:41.03
作者及单位:中科院遗传发育所吴昆博士和王栓锁博士为论文共同第一作者,傅向东研究员和Nick Harberd教授为该论文的共同通讯作者。
ABclonal引用产品:SLR1(A16279)

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推荐理由:这是傅向东团队继2018年在nature上发表Modulating plant growth-metabolism coordination for sustainable agriculture后,又一次在水稻氮高效利用领域取得突破性进展,这一研究报道了赤霉素信号传导新机制提高水稻氮肥利用效率的研究成果。该发现不仅深化了对赤霉素信号传导和植物氮素响应相互作用机制的理解,从分子层面上阐明了水稻高产和高氮利用效率的相互关系,而且找到了一条在保证产量提高的同时,降低化肥投入、减少环境污染的育种新策略,为培育“少投入、多产出、保护环境”的绿色高产高效新品种奠定了理论基础,并提供了有育种应用价值的基因资源。该论文被Science杂志选为该期的封面文章进行重点推荐。

 

3.清华大学沈晓骅团队发现U1 snRNP调控非编码RNA结合染色质的新机制

题目:U1 snRNP regulates chromatin retention of noncoding RNAs
期刊:Nature
影响因子:43.07
作者及单位:清华大学沈晓骅实验室的尹亚飞博士为该论文的第一作者,尹亚飞博士和沈晓骅教授为该论文的共同通讯作者
ABclonal引用产品:p53(A5761) ,SNRNP200(A6063),p-SF3B1(AP0844),ACTB(AC004)

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推荐理由:U1snRNP在细胞中的丰富存在一直是一个让人困惑的问题。研究者首先建立和运用一套新颖的mutREL-seq方法来高精度筛选调控RNA定位的关键序列,意外发现了U1snRNP识别位点参与调控候选RNA的染色质滞留,而且U1snRNP更高水平地结合在lncRNA上。随后进一步证明了U1snRNP直接调控成熟lncRNA与染色质的结合,而不是通过影响RNA合成、加工或降解过程的动态变化所产生的间接影响。该工作不仅揭示了U1snRNP介导非编码RNA在染色质上功能和调控的新模式,而且拓宽了U1snRNP这一被广泛研究的小核糖核蛋白粒子的新颖功能。

 

4.南方科技大学郭红卫团队报道植物siRNA领域突破性进展

题目:Plant 22-nt siRNAs mediate translational repression and stress adaptation
期刊:Nature
影响因子:43.07
作者及单位:访问学生吴辉辉博士(北京大学)和研究助理教授李博生为第一作者,南方科技大学郭红卫教授为通讯作者
ABclonal产品:核心靶标NIA1的抗体订制,细胞浆内参抗体Anti-tubulin(AC010)和细胞核内参抗体Anti-H3(A2348)

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推荐理由:小干扰RNA(siRNA)对于真核生物的正常发育和免疫力至关重要。植物产生的siRNA的长度为21、22或24个核苷酸。21和24个核苷酸分别介导信使RNA的切割和DNA甲基化,但22个核苷酸的siRNA的生物学功能仍然未知。该研究鉴定和表征一组由植物中的DICER-LIKE 2(DCL2)蛋白产生的内源性22个核苷酸的siRNA。产生22个核苷酸的siRNA会触发基因沉默的扩增,并导致基因特异性和整体性的翻译抑制。此外,这些22个核苷酸的siRNA优先在环境胁迫下积累,尤其是那些源自NIA1 / 2的siRNA,它们起着抑制翻译,抑制植物生长和增强胁迫反应的作用。因此,该研究揭示了22个核苷酸的siRNA的独特特性,并揭示了它们在植物适应环境胁迫中的重要性。

 

5.美国杜克大学董欣年团队报道植物免疫反应调控新机制

题目:Formation of NPR1 Condensates Promotes Cell Survival during the Plant Immune Response
期刊:Cell
影响因子:38.637
作者及单位:杜克大学董欣年实验室Raul Zavaliev博士为该论文第一作者,董欣年教授为该论文通讯作者
ABclonal产品: NIMIM1(A20262)

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推荐理由:水杨酸SA是植物的防御激素,对于植物免疫至关重要。拟南芥的NPR1和NPR3/NPR4被认为是SA的受体。该研究发现,NPR1在SA作用下形成NPR1凝聚体 (salicylic acid-induced NPR1 condensates, SINCs)。通过对SINCs分析表明,NPR1通过调节多重应激反应,在决定植物免疫反应中细胞生存或死亡起到重要作用。该研究揭示了NPR4识别SA的结构基础,并为NPR蛋白的结构-功能关系提供了初步见识。未来的研究将需要阐明SA信号中NPR蛋白之间的复杂相互作用,并探索这些SA受体对工程植物的免疫力。

 

6.中山大学苏士成/许小丁/高志良发现线粒体circRNA可作为非酒精性脂肪肝炎治疗靶标

题目:Targeting Mitochondria-Located circRNA SCAR Alleviates NASH via Reducing mROS Output
期刊:Cell
影响因子:38.637
作者及单位:赵绮毅副研究员、刘嘉煜助理研究员、邓洪主任医师、马瑞颖研究生为该论文的共同第一作者,中山大学苏士成教授,许小丁教授和高志良教授为共同通讯作者
ABclonal产品: RNase L(A9840)

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推荐理由:该研究通过非酒精性脂肪性肝炎(NASH)患者肝成纤维细胞的环状RNA(circRNA)表达谱分析,确定了一种线粒体特异性circRNA——SCAR,在非酒精性脂肪性肝炎(NASH)中表达下调,向线粒体特异性递送SCAR,可降低线粒体活性氧(mROS)输出,减轻炎症,可作为NASH的治疗靶标。该研究揭示了线粒体定位的circRNA在代谢性炎症中发挥重要功能,并且率先构建靶向线粒体circRNA的纳米递送系统,实现在体内外干预线粒体定位circRNA,为靶向线粒体信号治疗代谢性免疫疾病提供新思路,为该疾病的临床治疗提供了全新方案。

 

7.加州大学圣地亚哥分校付向东团队揭示精子和卵细胞基因组整合的机制

题目:Initiation of Parental Genome Reprogramming in Fertilized Oocyte by Splicing Kinase SRPK1-Catalyzed Protamine Phosphorylation
期刊:Cell
影响因子:38.637
作者及单位:加州大学圣地亚哥分校苟兰涛博士、Do-Hwan Lim博士、马武斌博士为该研究论文的共同第一作者,付向东教授为通讯作者
ABclonal产品: SRPK1(A5854)

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推荐理由:研究人员发现,剪接激酶SRPK1通过催化鱼精蛋白的位点特异性磷酸化来触发受精卵母细胞中鱼精蛋白与组蛋白的交换。染色质开放性检测技术(ATAC-seq)从全基因组角度再次证明SRPK1介导的鱼精蛋白磷酸化对受精卵染色质重构起到重要起始调控作用,还进一步表明受精卵中父源及母源染色质的发育重构是相互协调和影响的。这项研究工作揭示受精后母源SRPK1催化父源基因组鱼精蛋白磷酸化并启动染色质重构,不仅为解析早期受精卵染色质发育事件提供了新线索,还将有助于后期精子细胞染色质重构的深入研究,并为相关人类不育症提供了新的视角与潜在治疗靶点。

 

8.中科院陈玲玲团队发现长非编码RNA种属特异性加工决定其功能差异

题目:Distinct processing of lncRNAs contributes to non-conserved functions in stem cells
期刊:Cell
影响因子:38.637
作者及单位:中国科学院分子细胞卓越创新中心(生物化学与细胞生物学研究所)陈玲玲研究员为该论文通讯作者,其博士研究生郭纯洁和中国科学院-德国马普计算生物学伙伴研究所杨力研究组博士研究生马旭凯为该论文的共同第一作者
ABclonal产品: STRAP(A5964)

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推荐理由:这项研究通过分离人、鼠胚胎干细胞细胞核和细胞质来源的RNA结合高通量测序分析,序列及基因组位置保守的长非编码RNA在人胚胎干细胞中更多的定位在细胞质内,而在鼠胚胎干细胞中则更多的滞留在细胞核内。该研究首次发现长非编码RNA在不同物种来源干细胞中的特异性加工是其发生适应性功能变化的重要机制,为深入理解长非编码RNA的功能及进化提供了新思路,丰富了领域对长非编码表达调控、定位和功能多样性的认识。

 

9.武汉大学中南医院刘胡丹团队报道白血病靶向治疗研究新成果

题目:Direct Phosphorylation and Stabilization of MYC by Aurora B Kinase Promote T-cell Leukemogenesis
期刊:Cancer Cell
影响因子:26.602
作者及单位:刘胡丹教授为该论文的通讯作者,武汉大学医学研究院博士研究生江珏、王敬超和华中科技大学附属武汉市中心医院岳明博士为共同第一作者
ABclonal产品: AURKC(A7930),cleaved Caspase-3(A11021),NCL(A5904),HA-tag(AE008),Myc-tag(AE010)

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推荐理由:MYC的失调在T细胞急性淋巴细胞白血病(T-ALL)中起着至关重要的作用,但其失调的机制仍然难以捉摸。研究人员发现Aurora B激酶(AURKB)直接磷酸化并稳定MYC来促进T细胞白血病的发生,而AURKB抑制剂诱导明显的MYC降解,并伴随强烈的白血病细胞死亡。这些发现揭示了作为T细胞白血病发生的AURKB-MYC调节回路,并为通过AURKB抑制致癌性MYC的治疗靶向提供了依据。

 

10.中国科学院生物物理研究所张晓荣团队阐述RNA干扰在线粒体中的应用

题目:Active RNA interference in mitochondria
期刊:Cell Research
影响因子:20.507
作者及单位:中国科学院生物物理研究所张晓荣研究员和加州大学圣地亚哥分校付向东教授为该论文共同通讯作者,博士研究生高宽兴和程满为共同第一作者
ABclonal产品: NDUFV2(A7442),SDHA(A2594),CYBB(A1636),UQCRFS1(A6784),ATP5B(A5769),NDUFA13(A5412),β-actin(AC026),H3(A2348),COX5A(A6437),COX5B(A2640),MRPL44(A4949),ERP44(A4526),CytB(A9762),ATP6(A8193)

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推荐理由:该文章证明miRNA能够进入线粒体;并通过胰酶保护试验证明了Ago2存在于线粒体基质。该研究工作揭示了miRNA调控的新机制,为线粒体基因表达调控增添了新的层级。截止目前为止,对线粒体基因功能的研究基本上都是通过突变细胞系来实现,而突变细胞系的会造成细胞产生适应性改变,而张晓荣团队发展的mitoRNAi可以排除这种适应性的改变,且可以将其扩展到线粒体基因功能的研究工作中。研究团队利用mitoRNAi技术研究了线粒体呼吸链复合体之间的调控,并为下一步研究工作提供了新的工具以及思路。更重要的是,mitoRNAi将为源于线粒体DNA突变的疾病治疗提供一种潜在的解决方案。

 

11.美国约翰霍普金斯大学发现抑制D因子可阻断新冠病毒棘突蛋白引起的补体激活

题目:Direct activation of the alternative complement pathway by SARS-CoV-2 spike proteins is blocked by factor D inhibition
期刊:Blood
影响因子:17.54
作者及单位:约翰霍普金斯大学医学院血液科主任Robert Brodsky博士为该论文通讯作者,Jia Yu,Xuan Yuan和Hang Chen为该论文共同第一作者
ABclonal产品:Recombinant SARS-COV-2 Nucleocapsid Protein with His tag(RP01264)

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推荐理由:SARS-CoV-2可触发补体介导的内皮细胞损伤,但机制不明。该研究发现通过阻断另一种在补体旁路途径上游起作用的补体蛋白,即D因子,能够阻止SARS-CoV-2引发的破坏性连锁事件。这项研究将会促进人们开展更多的研究来探究已在为治疗其他疾病中开发的补体抑制药物在治疗COVID-19中的潜在应用。

 

12.巴黎萨克雷大学医院发现全球首例新冠可通过母婴垂直传播

题目:Transplacental transmission of SARS-CoV-2 infection
期刊:Nature Communications
影响因子:12.121
作者及单位:巴黎萨克雷大学医院Antoine Béclère医院儿科与新生儿重症护理医学主任Daniele De Luca为该论文通讯作者,Alexandre J.Vivanti和Christelle Vauloup-Fellous为共同第一作者
ABclonal产品: SARS-COV-2 N Protein Rabbit pAb(A20016)

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推荐理由:该研究报告了首例由母体感染SARS-CoV-2的新生儿确诊病例,证明SARS-CoV-2经胎盘传播,并且新生儿具有与SARS-CoV-2感染相关的神经学临床症状。这项研究拓宽了人们对SARS-CoV-2可能通过胎盘垂直传播的认知。

 

13.华中科技大学附属协和医院张进祥团队揭示miR-210在肝脏缺血再灌注损伤中的作用机制

题目:miR-210 participates in hepatic ischemia reperfusion injury by forming a negative feedback loop with SMAD4
期刊:Hepatology
影响因子:14.679
作者及单位:协和医院急诊外科博士生潘文明为这篇论文的第一作者,张进祥教授为论文通讯作者
ABclonal产品: Mouse IL-1 beta ELISA Kit(RK00006)

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推荐理由:该研究发现肝脏缺血再灌注损伤过程中转录因子SMAD4能够入核并激活miR-210的表达,同时miR-210又能靶向抑制SMAD4形成负反馈循环抑制SMAD4的抗凋亡效应。肝脏缺血再灌注损伤过程中miR-210与SMAD4反馈调控机制的阐明,对于通过开发miR-210小分子阻断药物治疗肝脏缺血再灌注损伤具有重要意义。

 

14.中科院生化细胞所刘默芳团队揭示LARP7介导U6修饰与RNA剪接在精子发生过程中的作用

题目:LARP7-Mediated U6 snRNA Modification Ensures Splicing Fidelity and Spermatogenesis in Mice
期刊:Molecular Cell
影响因子:14.548
作者及单位:刘默芳研究员(通讯作者),分子细胞中心博士后王鑫、博士研究生李智彤、闫越和中山大学博士研究生林鹏辉(共同第一作者)
ABclonal产品: ABScript Ⅱ cDNA First-Strand Synthesis Kit(RK20400),GFP(AE011)

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推荐理由:该研究报道了LARP7蛋白通过促进U6 snRNA与具有RNA甲基化催化活性的box C/D snoRNP相互作用,介导了U6的2′- O -甲基化修饰,并进一步证明此过程为小鼠生精细胞中mRNA剪接保真性及精子发生必需。该研究为U6 2’-O-methylation修饰的生物学功能以及精子发生过程中mRNA剪接的调控提供了理论基础。

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