ABclonal丨六大系列产品应对NGS文库构建难题

2020年8月25日 | 评论0 | 阅读2,919 | 点赞0

NGS（下一代测序）技术凭借高通量、精确性高和信息量丰富等优点，在基础研究、产前诊断、遗传病诊断、肿瘤诊断与精准医疗领域迅速崛起。NGS实验流程包括核酸提取、文库构建、上机测序、数据分析等步骤，其中文库构建是非常关键的一环，对整个实验结果影响最大。ABclonal 长期专注于NGS文库构建试剂盒和相关原料酶产品的开发，拥有六大系列产品（Rapid系列、FS系列、OneStep系列、Scale系列、Mega系列、转录组系列），能够提供完善的NGS文库构建解决方案。

1、超声打断法-Rapid系列

Rapid系列DNA文库构建试剂盒采用最经典的文库构建技术，能将1-1000 ng片段化的DNA转化为适于illumina平台的DNA测序文库。在Rapid系列文库构建试剂盒操作简单，末端修复和加A合为一步，整个建库过程可以在2个小时完成。

Rapid系列分为五个单品（Rapid CM，Rapid CE，Rapid，Rapid Plus，Rapid Max），分别对应着不同的应用需求，其中Rapid CM价格最低，而Rapid Max性能最高。另外，Rapid Plus和Rapid Max作为两款高端建库试剂盒，能够兼容DNA损伤修复模块（DDRE），可以修复大多数的损伤DNA，配合ABclonal 截短型DNA测序接头，能极大的增加了FFPE，cfDNA等临床样本的文库构建成功率，非常适合肿瘤的研究。

➤关键词：经典，稳定

2、片段化酶法-FS系列

FS系列采用片段化酶法进行文库构建，且在DNA片段化的同时，进行了末端修复和加A，从而缩短了实验流程。整个实验流程非常简单，大概1.5h就可以完成DNA建库，便于大量样本的同时建库。

FS系列采用片段化酶法进行DNA的片段化，从而避免了超声波破碎仪以及相关耗材的使用，降低了实验门槛和成本，而且还能减少样本的损失，增加了建库效率。FS系列DNA建库试剂盒能够兼容0.1-1000 ng的DNA样本，也能兼容不同损伤程度的FFPE样本的高效建库，能适用于包括肿瘤诊断在内的各种下游应用。

➤关键词：简单方便，无门槛

3、OneStep系列（转座酶法）

OneStep系列采用Tn5转座酶法进行DNA文库的构建，Tn5转座酶能够同时对DNA进行片段化和加接头，因此整个建库实验流程只包括DNA的片段化以及文库的扩增两个步骤，操作极为简单。

Tn5转座酶对于样本投入量比较敏感，因此OneStep系列分为三个单品，分别针对1 ng，5ng和50ng的起始量，分别对应不同的起始量样本的文库构建。如果DNA的投入量过多或者过少，会造成过度酶切或者酶切不足的问题。另外，ABclonal 还推出了OneStep Flex产品，将Tn5转座酶偶联在磁珠上，使得Tn5转座酶对DNA的片段化更加的可控化，能够降低Tn5转座酶对DNA投入量的敏感性，从而能同时兼容1-500 ng的起始量样本的转座酶法DNA文库构建。

➤关键词：快速

4、单链建库/甲基化建库-Scale系列

Scale ssDNA系列是基于单链DNA（ssDNA）建库技术的DNA文库构建试剂盒，单链DNA建库技术可以快速高效地将T7 Truncated Adapter连接到单链 DNA的3‘端，不依赖于T/A连接技术，不再受限于DNA末端的完整性，DNA起始量，接头浓度等，实现了DNA连接效率的最大化，能极大的提高超低起始量和严重降解样本的DNA文库构建。

Scale系列主要包括两款建库试剂盒，分别是Scale ssDNA-seq Lib Prep Kit for Illumina和Scale Methyl-DNA Lib Prep Kit for Illumina。其中Scale ssDNA-seq Lib Prep Kit适用于超低起始量（10 pg-200 ng）和严重降解样本的DNA文库构建，构建的文库能用于全基因组重测序和靶向捕获测序等下游应用。Scale Methyl-DNA Lib Prep Kit 主要用于DNA甲基化文库的构建，相比于传统的全基因组重亚硫酸盐测序（WGBS）文库构建，Scale ssDNA的建库方式能够显著的降低样本起始量要求和测序数据的冗余率，并能提升测序准确率。

➤关键词：低起始量，甲基化

5、MGI平台-Mega系列

Mega系列DNA建库试剂盒是基于MGI（华大智造）测序平台的DNA文库构建试剂盒，MGI属于国产测序平台，在测序成本和性能方面较国外测序平台的优势日趋明显，Mega系列产品包含普通版、原料版和DDRE（DNA损伤修复模块）版，能够满足不同的应用需求。

➤关键词：国产化替代

6、RNA seq-转录组系列

ABclonal 转录组系列产品包括普通mRNA建库试剂盒，链特异mRNA建库试剂盒、全转录组建库试剂盒、小RNA建库试剂盒、以及快速RNA建库试剂盒和超快速RNA建库试剂盒等，能够满足不同类型转录组的测序需求。

其中快速RNA建库试剂盒和超快速RNA建库试剂盒分别能在5h和2h内完成RNA的文库构建，且能同时兼容普通mRNA和链特异mRNA文库的构建。所有的RNA文库构建试剂盒都能可以和ABclonal的Oligo dT捕获磁珠或者rRNA去除模块进行配套使用。另外ABclonal所有的转录组建库试剂盒都采用短接头，能够增加建库效率。

➤关键词：快速（5h），超快速（2h）