新品上市:快速RNA建库试剂盒Fast RNA-Seq Lib Prep Module

 

导语

文库构建是NGS中的关键环节,和DNA文库构建相比,RNA文库构建步骤繁琐,耗时更多。DNA文库的构建一般只需要2-3 hr,而RNA文库的构建一般需要7-8 hr。冗长的操作步骤给RNA文库构建实验安排带来了不便,特别是一次需要构建多个RNA文库时,很难在一个工作日内完成。

针对以上问题,ABclonal 带来了快速RNA建库试剂盒Fast RNA-Seq Lib Prep Module(RK20304),将传统RNA文库构建过程中的二链合成、末端修复和加A步骤合成一步,使得原来7-8 hr的实验过程缩短到5-6 hr,而文库质量相对于传统方法并没有明显变化,极大提升了RNA文库构建的效率。

 

>>>>产品特点

①适用于illumina平台
②Total RNA起始量为10 ng-1 μg
③支持非链特异性和链特异性两种建库方式
④二链合成、末端修复、加A一步完成,总时长从原来7-8 hr缩短到5-6 hr
⑤兼容多种 mRNA纯化模块和RNA adaptor
⑥试剂盒建议采用RNA truncated adaptor(配套产品见下文)

 

>>>>实验流程

《新品上市:快速RNA建库试剂盒Fast RNA-Seq Lib Prep Module》

 

>>>>配套产品

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>>>>不同RNA投入量及打断时间建库产量

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*文库产量为两次平行实验结果

 

>>>>数据展示

1. 测序数据质量高

《新品上市:快速RNA建库试剂盒Fast RNA-Seq Lib Prep Module》

测序数据质量高:以100 ng和1μg的小鼠总RNA为模板,分别用ABclonal的快速 RNA建库(Fast RNA-Seq)以及ABclonal 常规mRNA-seq建库(ab_mRNA-Seq, ab_strand mRNA-Seq)方法进行链特异和非链特异建库,测序数据QC分析显示快速建库和常规建库的测序质量相当,Q20均在98%左右,Q30均在94%左右。

 

2. Mapping rate 高

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mapping 率高:分别用 ABclonal的 fast RNA-seq (ab_fast)和常规RNA建库试剂盒(ab_mRNA),以及竞品试剂盒(va-),对小鼠总 RNA进行链特异以及非链特异文库构建,测序结果分析表明,ABclonal fast RNA-seq在 mapping rate、duplication rate上表现良好,与ABclonal常规RNA-seq试剂盒相当,并略好于竞品。

 

3. 测序结果一致性好

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测序结果一致性好:用ABclonal fast RNA-seq 分别对100 ng和1 μg的同一份小鼠RNA进行建库测序,分析结果显示,同一份RNA样本的不同起始量测序结果基本一致,非链特和链特测序相关性分别达到了98%和99%,并与ABclonal普通mRNA建库试剂盒 (ab_) 以及竞品(va_)试剂盒测序结果相关性均达到90%以上。

 

 

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