导语
针对以上问题,ABclonal 带来了快速RNA建库试剂盒Fast RNA-Seq Lib Prep Module(RK20304),将传统RNA文库构建过程中的二链合成、末端修复和加A步骤合成一步,使得原来7-8 hr的实验过程缩短到5-6 hr,而文库质量相对于传统方法并没有明显变化,极大提升了RNA文库构建的效率。
>>>>产品特点
①适用于illumina平台
②Total RNA起始量为10 ng-1 μg
③支持非链特异性和链特异性两种建库方式
④二链合成、末端修复、加A一步完成,总时长从原来7-8 hr缩短到5-6 hr
⑤兼容多种 mRNA纯化模块和RNA adaptor
⑥试剂盒建议采用RNA truncated adaptor(配套产品见下文)
>>>>实验流程
>>>>配套产品
>>>>不同RNA投入量及打断时间建库产量
*文库产量为两次平行实验结果
>>>>数据展示
1. 测序数据质量高
测序数据质量高:以100 ng和1μg的小鼠总RNA为模板,分别用ABclonal的快速 RNA建库(Fast RNA-Seq)以及ABclonal 常规mRNA-seq建库(ab_mRNA-Seq, ab_strand mRNA-Seq)方法进行链特异和非链特异建库,测序数据QC分析显示快速建库和常规建库的测序质量相当,Q20均在98%左右,Q30均在94%左右。
2. Mapping rate 高
mapping 率高:分别用 ABclonal的 fast RNA-seq (ab_fast)和常规RNA建库试剂盒(ab_mRNA),以及竞品试剂盒(va-),对小鼠总 RNA进行链特异以及非链特异文库构建,测序结果分析表明,ABclonal fast RNA-seq在 mapping rate、duplication rate上表现良好,与ABclonal常规RNA-seq试剂盒相当,并略好于竞品。
3. 测序结果一致性好
测序结果一致性好:用ABclonal fast RNA-seq 分别对100 ng和1 μg的同一份小鼠RNA进行建库测序,分析结果显示,同一份RNA样本的不同起始量测序结果基本一致,非链特和链特测序相关性分别达到了98%和99%,并与ABclonal普通mRNA建库试剂盒 (ab_) 以及竞品(va_)试剂盒测序结果相关性均达到90%以上。